Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTBP1Q13363 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTBP1Q13363 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms