Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTK7Q13308 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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PTK7Q13308 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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PTK7Q13308 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTK7Q13308 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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