Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IFT88Q13099 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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