Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPS1Q13098 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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