Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COX10Q12887 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COX10Q12887 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
COX10Q12887 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms