Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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GTF3C1Q12789 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C1Q12789 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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