Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TFF3Q07654 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms