Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms