Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNG1Q06432 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms