Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms