Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC18A2Q05940 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A2Q05940 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms