Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHRNEQ04844 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHRNEQ04844 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms