Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EMX2Q04743 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms