Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF8Q02556 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF8Q02556 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms