Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSG1Q02413 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms