Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PLCB3Q01970 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PLCB3Q01970 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms