Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZBED6P86452 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZBED6P86452 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms