Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMF1P82094 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMF1P82094 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMF1P82094 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMF1P82094 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMF1P82094 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMF1P82094 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMF1P82094 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMF1P82094 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMF1P82094 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMF1P82094 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMF1P82094 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMF1P82094 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMF1P82094 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMF1P82094 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMF1P82094 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMF1P82094 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMF1P82094 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMF1P82094 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMF1P82094 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMF1P82094 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMF1P82094 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMF1P82094 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMF1P82094 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMF1P82094 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMF1P82094 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMF1P82094 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMF1P82094 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMF1P82094 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMF1P82094 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMF1P82094 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMF1P82094 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMF1P82094 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMF1P82094 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMF1P82094 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMF1P82094 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMF1P82094 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMF1P82094 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMF1P82094 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMF1P82094 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMF1P82094 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMF1P82094 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMF1P82094 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMF1P82094 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMF1P82094 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMF1P82094 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMF1P82094 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMF1P82094 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMF1P82094 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMF1P82094 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMF1P82094 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMF1P82094 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMF1P82094 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMF1P82094 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMF1P82094 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMF1P82094 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMF1P82094 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMF1P82094 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMF1P82094 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms