Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF3P78545 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF3P78545 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF3P78545 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF3P78545 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF3P78545 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF3P78545 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELF3P78545 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF3P78545 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELF3P78545 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ELF3P78545 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELF3P78545 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELF3P78545 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELF3P78545 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELF3P78545 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELF3P78545 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF3P78545 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF3P78545 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms