Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM193AP78312 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms