Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVS71-1P61550 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVS71-1P61550 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms