Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB15P59190 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB15P59190 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB15P59190 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB15P59190 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB15P59190 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB15P59190 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB15P59190 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB15P59190 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB15P59190 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms