Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3AP57075 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms