Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRPF1P55201 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRPF1P55201 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms