Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms