Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KRT6CP48668 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRT6CP48668 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms