Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOX2P48431 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOX2P48431 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOX2P48431 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX2P48431 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX2P48431 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOX2P48431 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms