Protein–RNA interactions for Protein: P43657

LPAR6, Lysophosphatidic acid receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR6P43657 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPAR6P43657 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms