Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GDF5P43026 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GDF5P43026 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF5P43026 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF5P43026 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF5P43026 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF5P43026 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF5P43026 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF5P43026 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF5P43026 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF5P43026 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF5P43026 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GDF5P43026 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF5P43026 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF5P43026 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF5P43026 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF5P43026 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF5P43026 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF5P43026 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GDF5P43026 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms