Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PCGF2P35227 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PCGF2P35227 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms