Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP2P32456 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP2P32456 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP2P32456 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP2P32456 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP2P32456 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP2P32456 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP2P32456 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP2P32456 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP2P32456 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP2P32456 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP2P32456 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP2P32456 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP2P32456 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBP2P32456 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms