Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGA1P29973 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms