Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GJB2P29033 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GJB2P29033 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GJB2P29033 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GJB2P29033 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJB2P29033 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB2P29033 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB2P29033 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB2P29033 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB2P29033 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB2P29033 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB2P29033 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB2P29033 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB2P29033 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB2P29033 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB2P29033 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB2P29033 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB2P29033 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB2P29033 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB2P29033 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB2P29033 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJB2P29033 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJB2P29033 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJB2P29033 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms