Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCAP28676 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCAP28676 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCAP28676 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCAP28676 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCAP28676 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCAP28676 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GCAP28676 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCAP28676 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCAP28676 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCAP28676 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCAP28676 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCAP28676 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms