Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA6P23229 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms