Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCLP19338 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCLP19338 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCLP19338 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCLP19338 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCLP19338 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCLP19338 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCLP19338 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCLP19338 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCLP19338 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCLP19338 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms