Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP3P12645 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP3P12645 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP3P12645 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP3P12645 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP3P12645 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP3P12645 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP3P12645 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BMP3P12645 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BMP3P12645 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BMP3P12645 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BMP3P12645 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BMP3P12645 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BMP3P12645 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BMP3P12645 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BMP3P12645 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP3P12645 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP3P12645 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP3P12645 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP3P12645 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP3P12645 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP3P12645 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP3P12645 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP3P12645 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP3P12645 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP3P12645 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP3P12645 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP3P12645 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP3P12645 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP3P12645 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP3P12645 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms