Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ODC1P11926 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ODC1P11926 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ODC1P11926 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ODC1P11926 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODC1P11926 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODC1P11926 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODC1P11926 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODC1P11926 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODC1P11926 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ODC1P11926 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODC1P11926 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODC1P11926 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODC1P11926 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODC1P11926 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODC1P11926 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODC1P11926 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODC1P11926 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODC1P11926 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODC1P11926 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODC1P11926 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ODC1P11926 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ODC1P11926 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms