Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GLI4P10075 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GLI4P10075 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GLI4P10075 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GLI4P10075 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GLI4P10075 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms