Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPRCP08575 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms