Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL4A1P02462 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms