Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC24BO95487 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24BO95487 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms