Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRATO95237 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LRATO95237 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRATO95237 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRATO95237 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRATO95237 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRATO95237 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRATO95237 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LRATO95237 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LRATO95237 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LRATO95237 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LRATO95237 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms