Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UFL1O94874 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UFL1O94874 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFL1O94874 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFL1O94874 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFL1O94874 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFL1O94874 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFL1O94874 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFL1O94874 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFL1O94874 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UFL1O94874 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFL1O94874 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFL1O94874 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFL1O94874 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFL1O94874 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFL1O94874 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFL1O94874 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UFL1O94874 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFL1O94874 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFL1O94874 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFL1O94874 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFL1O94874 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UFL1O94874 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFL1O94874 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFL1O94874 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UFL1O94874 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFL1O94874 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFL1O94874 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFL1O94874 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFL1O94874 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFL1O94874 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFL1O94874 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFL1O94874 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFL1O94874 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFL1O94874 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFL1O94874 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFL1O94874 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFL1O94874 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFL1O94874 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms