Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSO75390 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSO75390 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSO75390 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSO75390 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSO75390 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSO75390 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSO75390 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSO75390 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSO75390 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSO75390 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSO75390 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSO75390 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSO75390 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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