Protein–RNA interactions for Protein: O15440

ABCC5, Multidrug resistance-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC5O15440 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC5O15440 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms