Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE40O14503 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms