Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRRT4C9JH25 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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