Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISM1B1AKI9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ISM1B1AKI9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms