Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOLGA6L9A6NEM1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GOLGA6L9A6NEM1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms